2009年11月23日月曜日

nageeeeeeeeee

現在4taxaでの諸々のシミュレーション実験の最終的なデータ収集を行っている。これは多分今週中には終わるものなのでいいが、問題は次の実験である。





taxaをもっと増加させたデータセットでの実験のプログラムを書いたはいいが、必要なデータをそろえるまでにすんごい時間がかかる。



簡単なテストでの所要時間から計算するにマナカナでフルコア使って塩基配列で一週間、アミノ酸では二週間くらいかかるだろう。





さらにこれら二つに対してポジコンも取らねばならず、そうするとかかる時間は・・・・・・・わお。







さすがにそこまでの時間を占有することはできないな・・・





この実験は次にどうするか決めるための予備実験だから、もうちょっとデータサイズを削るかあ。

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